作為一種程序性裁判機制，非法證據排除程序的意旨在于解決控辯雙方的證據合法性爭議，為法庭排除非法證據設立相應的操作規則。與偵查、起訴程序、庭前準備程序以及法庭審理程序相比較，非法證據排除程序具有自身特殊的性質。非法證據排除規則的適用程序是該規則得以有效實施的重要依托，在訴權保障和法官程序裁判權的規范上亦發揮著重要作用。這一程序的訴訟標的體現為兩個方面的程序性爭議，即偵查取證程序是否合法以及證據應否排除。對證據合法性的審查程序應具備兩造對抗、法官居中裁判的基本訴訟形態，法庭暫時變為程序性問題的裁判者，控辯雙方的訴訟角色發生轉換，涉嫌犯罪的被告人成為程序性裁判中的原告，而程序性裁判中的被告則是偵控方。非法證據排除程序與實體性裁判程序既密切關聯，又有重大差異，在訴訟中二者的關系呈現出相對獨立的態勢。